EEL-i peamised tegevussuunad ja eesmärgid kinnitatakse ühingu liikmete üldkoosoleku otsustega, mille kutsub juhatus kokku mitte hiljem kui kuue kuu jooksul arvates majandusaasta lõppemisest ja millel võivad hääleõigusega osaleda kõik liikmed.

EEL-i juhatuse liikmeteks on Ülar-Johannes Palm, Urmas Ambur, Erki Vabamets, Martin Saaremägi ja Reigo Ahven.

EEL-i igapäevatööd korraldab tegevdirektor Urmas Ambur.